汽车维修行业的管理部门涉及多个层级和部门，具体管理职责如下：

一、主要监管部门

交通运输部门（交通局/道路运输管理机构）

- 负责机动车维修行业的统筹管理，包括《机动车维修管理规定》的组织实施。

- 对汽车维修场站建设、维修资质审核、维修质量监督等实施监管。

- 配合工商部门核发营业执照，但主要侧重行业运营监管。

工商管理部门

- 负责汽车维修企业的工商注册登记、经营资质审查及市场行为监管。

二、其他相关监管部门

地方交通管理中心：

具体执行交通运输部门的监管职责，负责日常运营监督。

公安部门：涉及维修车辆的安全检测与事故车辆管理。

技术监督部门：对维修设备、工艺标准进行技术监督。

环保、消防、市政等部门：分别对维修厂的环保达标、消防安全及市政影响进行监管。

三、其他注意事项

4S店：除交通运输管理部门监管外，还需接受品牌总厂监督。

资质要求：需办理《道路运输经营许可证》《营业执照》等证件。

纠纷处理：可通过交通运输主管部门投诉，或向工商、消费者协会等机构维权。

综上，汽车维修行业实行多部门协同监管机制，确保规范运营与服务质量。