汽车维修公司需要缴纳的税种主要包括以下几种：

增值税

一般纳税人：增值税税率为17%。

小规模纳税人：增值税征收率为3%。

企业所得税

一般税率：25%。

小型微利企业：可能会有更低的税率。

城市维护建设税及教育费附加

城市维护建设税：通常基于企业应缴纳的增值税额计算，税率根据地区不同，一般为7%、5%或1%。

教育费附加：按缴纳的增值税额的3%缴纳。

地方教育费附加：按缴纳的增值税额的2%缴纳。

印花税

购销合同印花税：按购销金额的万分之三贴花。

账本印花税：按5元/本缴纳，每年启用时。

年度印花税：按“实收资本”与“资本公积”之和的万分之五缴纳（第一年按全额缴纳，以后按年度增加部分缴纳）。

房产税

计算方式：按自有房产原值的70%乘以1.2%的税率计算缴纳。

土地使用税

计算方式：按企业实际占用的土地面积和当地规定的税额标准征收。

车船税

计算方式：按车辆缴纳（各地规定不一，不同车型税额不同）。

个人所得税

适用范围：汽修厂中的个人收入，如工资、奖金等，在超过一定限额后需要缴纳个人所得税。

建议汽车维修公司在经营过程中，咨询专业的税务顾问，以确保准确申报和缴纳各项税费，避免因税务问题影响企业的正常运营和信誉。